ეროვნული თავდაცვის აკადემიაში, როგორც საბაკალავრო, ისე სამაგისტრო საფეხურზე ხორციელდება შიდა მობილობა. ბაკალავრიატის საფეხურზე სწავლის სპეციფიკიდან გამომდინარე ხორციელდება მხოლოდ შემოდგომის გარე მობილობა.
გარე მობილობით გადმოსული იუნკერები სწავლას იწყებენ პირველი კურსიდან.